Il s'agit souvent des cas les plus difficiles à faire. La nécropsie doit être complète et minutieuse et permet dans certains cas de déterminer quels tissus devraient être soumis. Les tissus essentiels à soumettre au laboratoire sont les suivants:
 

• Coeur (ventricule gauche, ventricule droit et septum interventriculaire)
• Foie
• Rein
• Poumon (3 à 4 prélèvements)
• Rate
• 2 sections d'intestin grêle ( 2 à 3 prélèvements incluant une plaque de Peyer)
• Colon (2 sections)
• Demi cerveau coupé longitudinalement
• Glande mammaire
• Muscles squelettiques (4 à 5)
• Tout autre tissu ayant un aspect anormal

• Demi cerveau
• Poumon
• Foie
• Rein

• Humeur aqueuse dans un tube à biochimie (pour dosage de l'urée)
• Contenu du rumen
• Rein
• Foie